Tras la caída del reino visigodo de Toledo, entre el 711 y el 718, el bereber Otman ben Neza conocido como Munuza fue nombrado gobernador de la región de Asturias, en el noroeste de la península ibérica, estableciéndose en la ciudad de Gijón, a orillas del mar Cantábrico.
Su autoridad fue rápidamente desafiada por algunos dirigentes astures que, encabezados por Pelayo, que decidieron no pagar los impuestos exigidos por los musulmanes. Por esto, Munuza se propuso castigar a los rebeldes, pero tras algunas escaramuzas de resultados inciertos, solicitó refuerzos al gobernador de Córdoba. Este despachó un cuerpo expedicionario de 187 mil hombres, al mando del general Al Qama o Alkamán. Acompañaba al ejército el arzobispo Oppas, traidor a su patria y a su fe. Leer más
Era el puerto natural de Santiago, pero no fue hasta 17 de abril de 1791 que el Gobernador de Chile el Barón de Ballenary Don Ambrosio O’Higgins fundó el cabildo porteño. Uno de los múltiples cerros que protegen la bahía, el cerro Barón lleva ese nombre en honor al fundador del municipio.
No fue hasta 1802, que el Rey de España le diera el título de «Ciudad de Nuestra Señora de las Mercedes de Puerto Claro», en honor a su patrona, que aparece en el escudo oficial. También es conocida como la «Joya del Pacifico», o como «Pancho» por los marinos en alusión a la torre de la iglesia de San Francisco que se divisa entrando en la bahía. 
Conocido como el Cristo de Mayo, es un venerado crucifijo de madera policromada con la imagen del Señor de la Agonía. Fue realizado por Fray Pedro de Figueroa de la orden de San Agustín en 1613, es icono del arte sacro de estilo barroco.
Años después, el 13 de mayo de 1647 se produce un violento terremoto en la zona central, se estima que debió ser 8.5° Richter, debido a la magnitud y alcance de los daños producido puesto que destruyo ciudades enteras, y se calcula que hubo más de 1000 muertos. En Santiago, todo cayó al suelo exceptuando parte de la Iglesia de San Francisco y algunos muros de la Iglesia de San Agustín incluyendo el que sostenía al Señor de la Agonía, se dice quela oscuridad era total salvo los cirios que iluminaban al crucifijo entre las ruinas de la ciudad y los gemidos y llantos, la población se volcó con rezos a la imagen sacra.